A Panigale V4 S az új SmartEC3.0 elektronikusan vezérelt Öhlins felfüggesztésben, a kovácsolt alumínium kerekekben és a lítium akkumulátorban különbözik a V4-től. Elérhető Racing Livery kivitelben is, amelyet a Desmosedici GP 2025 ihletett.